رنگ داپی که به نام رنگ DAPI نیز شناخته می‌شود، حاوی رنگ فلورسنت مناسب برای رنگ‌آمیزی DNA سلول می‌باشد. رنگ DAPI که کوتاه شده 4′، 6-دی آمیدینو-2-فنیلیندول است، برای مطالعه و تحلیل چرخه سلولی و مشاهده هسته سلول‌ها کاربرد دارد. نکته قابل‌توجه در این رنگ‌آمیزی، رنگ‌پذیری DNA دو رشته‌ای کامل و سالم است. این رنگ در محدوده UV به رنگ آبی قابل‌مشاهده است. همچنین از DAPI در تکنیک‌های IHC و ICC استفاده می‌شود.

کاربرد DAPI

•  محلول DAPI معمولاً برای تشخیص مایکوپلاسما در کشت سلولی به کمک میکروسکوپ فلورسانس استفاده می‌شود.
• این محلول چندین برابر حساس‌تر از اتیدیوم بروماید برای رنگ‌آمیزی DNA در ژل آگارز بوده و ممکن است برای فوتوفوت پرینت DNA، شناسایی پروب‌های آنیل شده در تکنیک بلات با تجسم خاص کمپلکس دو رشته‌ای، مطالعه تغییرات و تجزیه‌وتحلیل محتوای DNA در طول آپوپتوز با استفاده از فلوسیتومتری استفاده می‌شود.
• از DAPI برای رنگ‌آمیزی هسته در تست‌های Immunohistochemistry (IHC) و Immunocytochemistry (ICC) نیز استفاده می‌شود.

مکانیسم DAPI  

بعد اضافه‌کردن محلول به سلول‌های محیط کشت، DAPI به طور انتخابی به DNA دو رشته‌ای متصل شده و کمپلکس‌های فلورسنت DNA-DAPI را تشکیل می‌دهد. این عمل کمک می‌کند سلول‌های آلوده به مایکوپلاسما به‌آسانی شناسایی شود.

نکات تکمیلی DAPI

• غلظت محلول نهایی 25 mg/ml می‌باشد که در دمای 2 تا 8 درجه سانتیگراد به مدت حدود 6 ماه و در دمای 15- تا 25- درجه سانتی‌گراد به مدت 12 ماه پایدار است.
• این ماده در MSDS خود دارای برچسب غیر توکسیک است و اگرچه در باکتری  E. coli موتاژن نبوده اما ازآنجاکه یک ترکیب کوچک اتصال شونده به DNA است، احتمالاً دارای برخی اثرات کارسینوژنیک است.