تیمار DNA با بیسولفیت ( HSO3) سبب می‌شود که بازهای غیر متیله سیتوزین گروه آمین خود را از دست بدهد و به باز یوراسیل تبدیل شود که همانند باز تیمین مکمل باز آدنین می‌باشد. بنابراین در واقع باز سیتوزین بدون متیله به باز T تبدیل خواهد شد.اما درصورتی‌که باز سیتوزین به‌صورت متیله باشد تیمار بیسولفیت اثری بر روی این باز نخواهد داشتبنابراین به‌وسیله تیمار DNA به‌وسیله بیسولفیت و بررسی تبدیل باز C به باز T می‌توان به متیله بودن و یا غیر متیله بودن بازهای C پی برد. در واکنش تیمار DNA با بیسولفیت، ابتدا DNA برای ایجاد رشته‌های تکی دناتوره می‌شود و سپس با سدیم بیسولفیت تیمار شده تا نوکلئوتیدهای سیتوزین غیر متیله به یوراسیل تبدیل شوند درحالی‌که نوکلئوتیدهای متیله سیتوزین (5mC) دست نخورده باقی می‌مانند. بعد از تیمار رشته‌های DNA با بیسولفیت نوبت به بررسی تغییر بازهای C به t با روش PCR می‌باشد. برای بررسی متیلاسیون توسط روش بیسولفیت دو روش اصلی بر اساس تکنیک PCR وجود دارد. روش methylation-Specific PCR (MSP) و روش bisulfite Sequencing PCR(BSP) شایع‌ترین روش‌های استفاده شده برای تشخیص متیلاسیون می‌باشند.
تامین کیت و مواد مصرفی برای انجام تیمار بی سولفیت نمونه های DNA امکان پذیر می باشد.